生命科学学院邓兴隆、朱丹萌团队在高等植物中
来源:对战网 发表于2019-08-02 16:51:49 编辑:哈登
摘要: 非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA)是由基因组转录发作的一类不翻译成蛋白质的结构或功用性RNA分子。近年来跟着深度测序技能的不断更新开展及生物信息学猜测

 

生命科学学院邓兴隆、朱丹萌团队在高等植物中等长度非编码RNA的研讨中获得系列发展

非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA)是由基因组转录发作的一类不翻译成蛋白质的结构或功用性RNA分子。近年来跟着深度测序技能的不断更新开展及生物信息学猜测水平的大力提高,人们判定并注释了多种形式生物中的ncRNA。日益增多的研讨依据标明它们在生物体的生长发育、信号呼应及多种严重疾病的发作等重要生命活动进程中发挥着要害的调控效果,有关ncRNA的功用研讨已经成为整个生命科学研讨的前沿之一。可是高级植物中等长度非编码RNA (50 - 300 nt)的体系研讨亟待完善,单个ncRNA分子的功用研讨为数尚少。

生命科学学院邓兴隆、朱丹萌团队依托蛋白质与植物基因研讨国家重点实验室与中国科学院生物物理研讨所陈润生院士团队协作,使用改善的ncRNA别离建库战略并结合454深度测序技能在全基因组水平体系判定与剖析了高级形式植物水稻(Liu et al., 2019. Molecular Plant)和拟南芥(Wang et al., 2019. Molecular Plant)中全新中等长度ncRNA近千个。这些数据添补与拓宽了公共数据库中该类分子的注释信息,为全面解析和深化探究这些分子的功用与效果机制供给了基础性渠道。

 

 

 

 

高级植物研讨范畴已宣布的个例ncRNA功用研讨显现它们可以参加植物营养元素稳态调理、环境诱导的开花时刻调理及育性操控等多个植物特有的生物学进程,可是尚无较长ncRNA直接参加形式植物拟南芥光形状建成这一要害麦苗发育调控进程的分子依据。

团队在前期作业的基础上经过大规模反向遗传学挑选,获得了一个特异在红光条件下发作光形状建成不灵敏表型的ncRNA突变体。研讨确认了主效ncRNA分子可作为新层次调理因子参加拟南芥麦苗光形状建成的调理,并将其命名为HID1(HIDDEN TREASURE 1)。结合遗传学与分子生物学手法,该项目提醒了HID1首要经过反式效果的方法直接参加按捺光形状建成要害按捺因子PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR 3 (PIF3)基因的转录,然后介导拟南芥红光信号中的下胚轴伸长按捺。一起,该作业发现了HID1分子在红光下发挥功用的要害结构序列,并阐明晰这些序列结构与功用的保存性。HID1分子的发现不只提醒了植物光控发育进程中调理型RNA因子的参加,并且HID1的结构、功用与进化方面的剖析将为进一步提醒高级植物中较长ncRNA的效果机理供给一个值得深化研讨的典型事例。上述研讨成果于2019年6月30日在《美国科学院院报》(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)在线宣布,标题为Arabidopsis noncoding RNA mediates control of photomorphogenesis by red light ,博士生王玉秋为文章的榜首作者,朱丹萌副研讨员与邓兴隆教授是本文的一起通讯作者。

以上作业得到了国家自然科学基金委员会、科技部、北京大学蛋白质与植物基因研讨国家重点实验室与北大-清华生命科学联合中心的赞助。

 

 

 

修改:歆琴

 

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